拉賈安帕特（Raja Ampat）地質(zhì)公園包括4個主要島嶼，其獨特之處在于擁有印尼最古老的裸露巖石單元（距今4.438億–3.589億年前的志留紀(jì)—泥盆紀(jì)），巖石單元的年齡幾乎是地球年齡的十分之一。最不尋常的地質(zhì)特征當(dāng)屬在第四紀(jì)（258萬-1.17萬年前）因海平面上升而形成的熱帶群島；由于喀斯特作用，這里水面上下均發(fā)育出許多溶洞。喀斯特地貌的主體是石灰?guī)r，其質(zhì)地柔軟、多孔隙，可溶于水。隨著雨水經(jīng)年累月地滲入，這種巖石逐漸被侵蝕，繼而形成這些溶洞。美麗的水下溶洞和非凡的海洋生物多樣性，吸引著大量水肺潛水愛好者。在這里，他們可以觀賞到幾千年前生活在該地帶的史前人類創(chuàng)作的巖石藝術(shù)。
占碑美蘭音（Merangin Jambi）地質(zhì)公園位于印度尼西亞蘇門答臘島中部，是獨特的“占碑植物群”化石的發(fā)現(xiàn)地。這些化石是當(dāng)今世界上唯一出露的該類植物化石，其名稱系指在形成于早二疊紀(jì)（2.96億年前）的巖層中發(fā)現(xiàn)的植物化石。所含植物包括苔蘚、原始針葉樹，以及依靠種子而非孢子進(jìn)行繁殖的種子蕨類植物。公園地勢東低西高，最高峰海拔2900米，位于3.3萬前的大噴發(fā)形成的馬蘇萊火山群。該地帶自史前時代就有人類居住，現(xiàn)還生活著多個土著群體，包括Orang Batin Lamo部落和Serampas部族。地質(zhì)公園內(nèi)有形成于中生代（2.52億-6600萬年前）的喀斯特地貌?？λ固厝芏磧?nèi)留存有史前人類器物，已被納入一個重要的考古研究項目。
該地質(zhì)公園地處蘇拉威西島南臂，位于馬羅斯（Maros）縣和龐戈普（Pangkep）縣境內(nèi)。當(dāng)?shù)厝丝谝圆技搴屯渝a族土著人民為主。雖然該地質(zhì)公園面積達(dá)5077平方公里，但其中一半以上（55.4%）隱于水下。公園與主島隔海相望，園內(nèi)共有39座島嶼。該群島散落在珊瑚礁三角區(qū)，是一處珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)保護(hù)中心。地質(zhì)公園以壯觀的塔狀喀斯特地貌和斯佩爾蒙德珊瑚礁群島而聞名。其覆蓋區(qū)域有著超過億年的歷史；那里留有古代生命形式的痕跡，現(xiàn)棲息著一些特有物種，例如，生活在華萊士線（將婆羅洲島和蘇拉威西島分隔開來的一條深海溝，以阿爾弗雷德-拉塞爾-華萊士命名，他與同時代的查爾斯-達(dá)爾文提出了近似的進(jìn)化理論）沿線的黑冠獼猴和蘇拉威西袋貓。地質(zhì)公園西側(cè)的土地屬于亞洲大陸構(gòu)造板塊，東側(cè)則屬于澳洲板塊，這也是造成這些相鄰島嶼上發(fā)現(xiàn)的物種如此多樣的原因。
伊真（Ijen）地質(zhì)公園位于東爪哇省外南夢（Banyuwangi）縣和文多禾梭（Bondowoso）縣境內(nèi)。地質(zhì)公園地處海峽和海洋之間，戰(zhàn)略位置優(yōu)越，因而成為人類遷徙和貿(mào)易的要沖。伊真火山是伊真破火山口系統(tǒng)中最活躍的火山之一。破火山口內(nèi)部及其邊緣發(fā)育有大約22座后破火山口火山錐。伊真湖是地球上酸性最強(qiáng)的火山口湖，也是同類湖中最大的一個。這里還會上演一種罕見的奇觀：高濃度的硫磺從活躍火山口向上溢出，然后與富氧大氣接觸并發(fā)生燃燒；隨著氣體的燃燒，會噴發(fā)出一種獨特的藍(lán)色電焰，這種火焰僅在夜間可見。水體本身呈酸性，因為它通過滲透進(jìn)火山地表之下來實現(xiàn)循環(huán)。
勿里洞地質(zhì)公園是邦加島勿里洞省的一部分，位于印度尼西亞首都雅加達(dá)以北約400公里處，北臨卡里馬塔海峽，東面和南面為爪哇海，西面為加斯帕爾海峽。該地質(zhì)公園包括勿里洞島和200多個小島，海域總面積為1.3萬平方公里，其中洋面約占三分之二。勿里洞以其壯觀的突巖（Tor）花崗巖地貌聞名，這些地貌是由侵蝕和風(fēng)化作用形成的大型獨立巖石露頭。它還擁有由隕石撞擊形成的罕見的似曜巖，又稱 “沙膽石”（Satam Stone）或 “勿里洞石”（Billitonite），以及獨特的礦藏，如東南亞地區(qū)最富有的單一錫礦南薩魯（Nam Salu）原生錫礦。該地質(zhì)公園地處史上重要的海上貿(mào)易和遷徙路線之上，生活著28.8萬人口，屬于沙旺部落等多個文化。居民主要收入來源是農(nóng)業(yè)、漁業(yè)和采礦業(yè)。
位于蘇門答臘島，這個大火山口是因74000年前超級火山爆發(fā)而形成的?；鹕娇谂璧乩锶欠e水，是印度尼西亞最大的火山湖。它位于海平面以上904米處，由約240立方千米的淡水組成，深505米。地表海拔約2000米。該區(qū)域下面的巖層由變質(zhì)沉積物組成，在石炭紀(jì)—二疊紀(jì)（300百萬年）期間的南極地區(qū)生成，是岡瓦納大陸的一部分，散布在火山口邊緣陡峭的懸崖壁周圍。在達(dá)到“超級火山”噴發(fā)后的平靜過程中，巖漿房殘余壓力將托巴湖底推高，并在火山口中部形成了薩莫西爾島。這是世界上最活躍，最容易復(fù)發(fā)的火山口。“火山口復(fù)蘇”仍然是火山學(xué)中最難以理解的過程之一。
龍目島位于巴厘島和松巴哇之間，系Sunda Kecil群島之一，近似圓形，擁有一條長達(dá)70公里的“尾巴”——半島。該島地質(zhì)以第四紀(jì)鈣堿性火山為主，其上覆蓋著新近紀(jì)碎屑沉積巖、中新統(tǒng)火山巖和古近紀(jì)侵入火成巖?；鹕骄C合體是由于印度洋板塊朝東南亞板塊邊緣下俯沖形成的。Lombok的Sasak人口是多民族和多文化的，其文化遺產(chǎn)的多樣性反映在諸如寺廟和老清真寺等建筑物中。
西爪哇省的塞樂杜-皇后港世界地質(zhì)公園以Ciletuh（塞樂杜）河和Palabuhanratu（皇后港）的名字命名，皇后港源于當(dāng)?shù)仃P(guān)于本地區(qū)守護(hù)者南洋女王的傳說。地質(zhì)公園中最古老的巖石是在歐亞板塊和印度洋板塊之間的俯沖過程形成的。目前，3個村落社區(qū)保留了祖輩的Kasepuhan傳統(tǒng)，特別是在農(nóng)業(yè)和水田耕作（稱為tatanen）。
色烏山（Gunung Sewu）是一片廣袤的多山石灰?guī)r地區(qū)，橫跨日惹和爪哇中東部，圓錐狀的巖溶丘陵是這里的標(biāo)志。180萬年前，石灰?guī)r升出海床表面，經(jīng)長期的溶蝕形成喀斯特地貌。石灰?guī)r上升是海岸階地、河流階地以及露頭砂巖形成的主要原因。早在18萬年前，這里就有人類的活動，在河岸、石灰?guī)r棚以及巖洞處都發(fā)現(xiàn)了居住地。色烏山的每個丘陵幾乎都有石階環(huán)繞，見證了當(dāng)?shù)厥来鷤鞒邢聛淼母飨鄬ω汃ね恋氐闹R。
2012年加入世界地質(zhì)公園，地質(zhì)公園以印度尼西亞巴厘島東北部的一個活火山為中心，處于22000前形成的兩個巨大破火山口之間，是太平洋火山帶長活火山鏈的一部分。該地區(qū)擁有非常豐富的宏或微火山地貌，是在過去幾千中由火山作用形成的，其中，巴圖爾火山是一個典型的由火山碎屑和熔巖流交替沉積形成的層型火山。地質(zhì)歷史時期，兩次巨大的火山爆發(fā)產(chǎn)生了神奇的火山口墻，并形成了今天的深火山口湖。自1800年以來，巴圖爾火山至少噴發(fā)了22次。巴厘島上擁有著眾多的自然和文化旅游景點，而巴圖爾活火山卻因其獨特的地質(zhì)內(nèi)涵和壯麗的風(fēng)景而獨樹一幟，文化方面，地質(zhì)公園也向人們展示了特色的與巴厘人印度教相關(guān)的當(dāng)?shù)仫L(fēng)俗。
